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RNA Seq pour « Single Cell » et tout type d’ARN

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Pôle d'applications

 PCR, QPCR, NGS

En bref

Pour les applications NGS (Next Generation Sequencing) RNA-Seq, les kits SMARTer® sont hautement sensibles et assurent la couverture complète du transcriptome directement à partir de cellules ou d’ARN total (pleine longueur ou dégradé tels que LCM ou FFPE). Ils sont conçus pour la synthèse d’ADNc ou la préparation de banques pour les principales plateformes NGS incluant Illumina® et Ion Torrent™.

Descriptif

Pour le séquençage d’ARN messagers : SMARTer® UltraLow RNA for Sequencing Kit
  • Extrême sensibilité : de 1 à 1000 cellules ou de 10pg à 10 ng d’ARN total de bonne qualité (RIN>8)
  • Polyvalent : ADNc synthétisé compatible avec les plateformes Illumina® et Ion Torrent™
  • Excellentes performances :
    • Nombre élevé de gènes détectés
    • Couverture complète du transcriptome sans biais 5’ ou 3’
    • Faible % d’ARN ribosomiques séquencés
  • Reconnu pour ses performances : nombreuses publications
Pour le séquençage de tout type d’ARN : SMART-Seq® Stranded for Mammalian single cell for Illumina®
  • Kit spécifique de brins
  • Sensible : à partir d’1 cellule ou 10 pg d’ARN total humain, souris et rat
  • A partir d’ARN de qualité variable (RIN >2)
    • ARN pleine longueur ou dégradés y compris ceux extraits d’échantillons FFPE et LCM
    • ARN codants ou non
  • Rapide : de l’ARN total à la banque Illumina® en 7 heures
  • Obtention de données reproductibles
Pour le séquençage d’ARN en faibles quantités et dégradés ou non polyA : SMARTer® Stranded total RNA-Seq for Illumina®
  • Kits spécifiques de brins
  • Compatibles avec tout type d’ARN dont ceux issus de tissus micro-disséqués au laser (LCM) ou FFPE
  • Protocole rapide : des ARN à la banque Illumina en 4-5 heures
  • Obtention de données reproductibles
  • 2 kits disponibles :
    • SMARTer® Stranded – Pico Mammalian : de 250 pg à 10 ng d’ARN total mammifère
    • SMARTer® Stranded RNA-Seq : de 10 ng à 100 ng d’ARN total
Pour les quantités d’ARN total mammifères > 100 ng : SMARTer® Stranded RNA-Seq – High Input

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